Definice a příklady RNA

RNA je zkratka pro ribonukleovou kyselinu. Kyselina ribonukleová je a biopolymer používá se pro kódování, dekódování, regulaci a expresi geny. Formy RNA zahrnují messengerovou RNA (mRNA), přenosovou RNA (tRNA) a ribozomální RNA (rRNA). RNA kódy pro aminokyselina sekvence, které mohou být kombinovány do formy proteiny. Kde je použita DNA, RNA funguje jako prostředník, přepisuje DNA kód tak, aby mohl být přeložen do proteinů.

RNA sestává z nukleotidů vyrobených z ribózového cukru. Atomy uhlíku v cukru jsou číslovány 1 'až 5'. Purin (adenin nebo guanin) nebo pyrimidin (uracil nebo cytosin) je připojen k 1 'uhlíku cukru. Přestože je RNA transkribována s použitím pouze těchto čtyř bází, jsou často modifikovány tak, aby poskytly více než 100 dalších bází. Patří mezi ně pseudouridin (Ψ), ribothymidin (T, nesmí se zaměňovat s T pro thymin v DNA), hypoxanthin a inosin (I). Fosfátová skupina připojená k 3 'uhlíku jedné molekuly ribózy se připojuje k 5' uhlíku další molekuly ribózy. Protože fosfátové skupiny na molekule ribonukleové kyseliny nesou negativní náboje, je RNA také elektricky nabitá. Vodíkové vazby se tvoří mezi adeninem a uracilem, guaninem a cytosinem a také guaninem a uracilem. Tyto vodíkové vazby vytvářejí strukturální domény, jako jsou vlásenky, vnitřní smyčky a vyboulení.

Oba RNA a DNA jsou nukleové kyseliny, ale RNA používá monosacharidovou ribózu, zatímco DNA je založena na cukru 2'-deoxyribose. Protože RNA má na svém cukru další hydroxylovou skupinu, je labilní než DNA a má nižší aktivační energii hydrolýzy. RNA používá dusíkaté báze adenin, uracil, guanin a thymin, zatímco DNA používá adenin, thymin, guanin a thymin. Také RNA je často jednovláknová molekula, zatímco DNA je dvouvláknová šroubovice. Molekula kyseliny ribonukleové však často obsahuje krátké sekce helixů, které molekulu skládají samy o sobě. Tato plná struktura dává RNA schopnost sloužit jako katalyzátor v podstatě stejným způsobem, jako proteiny mohou působit jako enzymy. RNA se často skládá z kratších nukleotidových řetězců než DNA.

Existují 3 hlavní typy RNA:

• Messenger RNA nebo mRNA: mRNA přináší informace z DNA do ribozomů, kde je přeložena za účelem produkce proteinů pro buňku. Je považován za kódující typ RNA. Každé tři nukleotidy tvoří kodon pro jednu aminokyselinu. Když se aminokyseliny spojí a jsou modifikovány po translaci, výsledkem je protein.
• Přeneste RNA nebo tRNA: tRNA je krátký řetězec asi 80 nukleotidů, který přenáší nově vytvořenou aminokyselinu na konec rostoucího polypeptidového řetězce. Molekula tRNA má antikodonovou sekci, která rozpoznává kodony aminokyselin na mRNA. Na molekule jsou také místa připojení aminokyselin.
• Ribozomální RNA nebo rRNA: rRNA je další typ RNA, který je spojen s ribozomy. Existují čtyři typy rRNA u lidí a dalších eukaryot: 5S, 5,8S, 18S a 28S. rRNA je syntetizována v jádru a cytoplazmě buňky. rRNA se kombinuje s proteinem a vytváří v cytoplazmě ribozom. Ribozomy pak vážou mRNA a provádějí syntézu proteinů.

Kromě mRNA, tRNA a rRNA existuje v organismech také mnoho dalších typů ribonukleové kyseliny. Jedním ze způsobů, jak je kategorizovat, je jejich role v syntéze proteinů, replikaci DNA a post-transkripční modifikaci, genové regulaci nebo parazitismu. Některé z těchto dalších typů RNA zahrnují:

• Přenosová messenger RNA nebo tmRNA: tmRNA se nachází v bakteriích a restartuje zastavené ribozomy.
• Malá jaderná RNA nebo snRNA: snRNA se nachází v eukaryotech a archaea a funguje ve sestřihu.
• Telomerasová RNA složka nebo TERC: TERC se nachází v eukaryotech a funguje v syntéze telomer.
• Enhancerová RNA nebo eRNA: eRNA je součástí genové regulace.
• RetrotransposonRetrotranspozony jsou typem self-množící se parazitické RNA.

• Barciszewski, J.; Frederic, B.; Clark, C. (1999). RNA biochemie a biotechnologie. Springer. ISBN 978-0-7923-5862-6.
• Berg, J.M.; Tymoczko, J.L.; Stryer, L. (2002). Biochemie (5. vydání). WH Freeman and Company. ISBN 978-0-7167-4684-3.
• Cooper, G.C.; Hausman, R.E. (2004). Buňka: molekulární přístup (3. vydání). Sinauer. ISBN 978-0-87893-214-6.
• Söll, D.; RajBhandary, U. (1995). tRNA: Struktura, biosyntéza a funkce. ASM Stiskněte. ISBN 978-1-55581-073-3.
• Tinoco, I.; Bustamante, C. (Říjen 1999). "Jak se RNA složí". Journal of Molecular Biology. 293 (2): 271–81. doi: 10.1006 / jmbi.1999.3001