Tvrdé dřevo nebo listnaté stromy mohou být poškozeny nebo usmrceny organismy způsobujícími chorobu zvanými patogeny. Nejvíc běžné choroby stromů jsou způsobeny houbami. Houby postrádají chlorofyl a získávají potravu živením (parazitujícími) stromy. Mnoho hub je mikroskopických, ale některé jsou viditelné ve formě hub nebo kaštanů. Také některé choroby stromů jsou způsobeny bakteriemi a viry. Patogeny mohou infikovat mnoho různých druhů stromů s podobnými příznaky nemoci. Toto jsou ty, na které bych chtěl oslovit zde:
Prášková plíseň je běžné onemocnění, které se objevuje jako bílá prášková látka na povrchu listů. Napadá všechny druhy stromů. Stromy nejčastěji napadené plísní jsou lípa, krabí, catalpa a chokecherry, ale téměř každý strom nebo keř může získat plíseň.
Onemocnění plísní se může objevit na jakémkoli stromě, ale nejčastěji se na něm vyskytuje boxelder, jilm, lípa a javor. Patogeny jsou tmavé houby, které rostou buď na medovici vyluhované sáním hmyzu, nebo na exsudovaném materiálu pocházejícím z listů určitých stromů.
Běžné onemocnění přenášené půdou zvané Verticillium alboatrum vstupuje do stromu skrze kořeny a způsobuje vadnutí listů. Světlé listy s matným vzhledem jsou patrné na začátku léta. Listy pak začnou padat. Nebezpečí je největší u vysoce citlivých stromů, jako jsou javor, katalpa, jilm a kamenné ovoce.
Termín „rakovina“ se používá k popisu usmrcené oblasti v kůře, větvi nebo kmeni infikovaného stromu. Desítky druhů hub způsobují rakovinu.
Onemocnění srdeční hniloby v živých stromech je způsobeno houbami, které pronikly do stromu otevřenými ranami a odkryly holé dřevo. Obvykle je „plodovým“ tělem konk nebo houba první příznak infekce. Všechny listnaté stromy mohou získat srdeční hnilobu.