Od té doby Charles Darwin nejprve přišel s Teorie evoluce a jeho nápad přírodní výběr, vývoj byl a kontroverzní téma pro mnoho lidí. Zatímco příznivci Theory poukazují na zdánlivě nekonečnou horu důkaz pro evoluci, kritici stále popírají, že evoluce je opravdu fakt. Jedním z nejčastějších argumentů proti evoluci je to, že v EU existuje mnoho mezer nebo "chybějících odkazů" fosilní záznam.
Tato chybějící spojení by byla tím, co vědci považují za přechodné fosílie. Přechodné fosílie jsou zbytky organismu, který vznikl mezi známou verzí druhu a současným druhem. Údajně by přechodné fosílie byly důkazem evoluce, protože by ukazovaly přechodné formy druhu a změnily se a hromadily se adaptace pomalým tempem.
Bohužel, protože fosilní záznam je neúplný, existuje mnoho chybějících přechodných fosilií, které by umlčely kritiky evoluce. Bez tohoto důkazu odpůrci teorie tvrdí, že tyto přechodné formy nemusely existovat a to znamená, že vývoj není správný. Existují však i jiné způsoby, jak vysvětlit nepřítomnost některých přechodných fosilií.
Jedno vysvětlení se nachází ve způsobu, jakým jsou fosílie vyráběny. Je velmi vzácné, že se z mrtvého organismu stane fosilie. Nejprve musí organismus zemřít ve správné oblasti. Tato oblast musí mít nějaký druh vody se sedimenty, jako je bahno nebo jíl, nebo organismus musí být konzervován v dehtu, jantaru nebo ledu. Pak, i když je na správném místě, není zaručeno, že bude zkamenělý. K uzavření organismu v sedimentární hornině, která se nakonec stane fosilií, je zapotřebí intenzivního tepla a tlaku po velmi dlouhou dobu. Také pouze tvrdé části těla, jako jsou kosti a zuby, přispívají k tomu, aby tento proces přežil a stal se fosilním.
I když se stalo, že se stane fosilie přechodného organismu, nemusí fosilie v průběhu času přežít geologické změny na Zemi. Skály se ve skalním cyklu neustále rozbijí, roztaví a mění se na různé typy hornin. To zahrnuje všechny sedimentární horniny, které mohly mít fosílie v nich najednou.
Rovněž jsou vrstvy hornin položeny na sebe. Zákon superpozice tvrdí, že starší vrstvy skály jsou na dně hromady, zatímco novější nebo mladší vrstvy sedimentární horniny, které jsou stanoveny vnějšími silami, jako je vítr a déšť, jsou blíže k horní. Vzhledem k tomu, že některé z přechodných fosilií, které dosud nebyly nalezeny, jsou staré miliony let, mohlo by to být tak, že je zatím ještě nebyly nalezeny. Přechodné fosílie by tam mohly být stále, ale vědci se prostě nezakopali dostatečně hluboko, aby se k nim dostali. Tyto přechodné fosílie lze nalézt také v oblasti, která dosud nebyla prozkoumána a vykopána. Stále existuje možnost, že někdo tyto „chybějící odkazy“ odhalí, protože paleontologové a archeologové v terénu prozkoumají více Země.
Dalším možným vysvětlením nedostatku přechodných fosilií by byla jedna z hypotéz o tom, jak rychle se evoluce stane. Zatímco Darwin tvrdil, k těmto adaptacím a mutacím došlo a pomalu se vytvářely v procesu zvaném gradualismus, jiní vědci věří v myšlenku velké změny, ke kterým došlo najednou, nebo přerušovaná rovnováha. Pokud je správný vzorec evoluce je interpunkční rovnováha, pak by neexistovaly žádné přechodné organismy, které by opustily přechodné fosílie. Proto by neexistoval legendární „chybějící článek“ a tento argument proti evoluci by již nebyl platný.