Vodní společenství jsou hlavní vodní stanoviště na světě. Jako půdní biomy, vodní společenství lze dále rozdělit na základě společných charakteristik. Dvě společná označení jsou sladkovodní a mořská společenství.
Sladkovodní společenství
Řeky a potoky jsou vodní útvary, které se neustále pohybují jedním směrem. Obě jsou rychle se měnící společenství. Zdroj řeky nebo potoka se obvykle výrazně liší od bodu, ve kterém se řeka nebo potok vypouští. V těchto sladkovodních komunitách lze nalézt různé rostliny a zvířata, včetně pstruhů, řasy, cyanobakterie, houbya samozřejmě různé druhy ryb.
Ústí jsou oblasti, kde se potoky sladké vody nebo řeky setkávají s oceánem. Tyto vysoce produktivní oblasti obsahují široce rozmanitý život rostlin a zvířat. Řeka nebo potok obvykle nese mnoho živin z vnitrozemských zdrojů, díky čemuž jsou ústí řek schopné podporovat tuto bohatou rozmanitost a vysokou produktivitu. Ústí řeky jsou krmivem a hnízdištěm různých zvířat, včetně vodních ptáků, plazi, savcia obojživelníci.
Jezera a rybníky jsou vodní útvary. Mnoho jezer a řek končí v jezerech a rybnících. Fytoplankton se obvykle nachází v horních vrstvách. Protože světlo je absorbováno pouze do určitých hloubek, fotosyntéza je běžné pouze v horních vrstvách. Jezera a rybníky také podporují celou řadu rostlinných a živočišných životů, včetně malých ryb, krevetek slaných, vodního hmyzu a četných druhů rostlin.
Námořní společenství
Oceány pokrývají přibližně 70% zemského povrchu. Námořní společenství je obtížné rozdělit na různé typy, ale lze je klasifikovat na základě stupně pronikání světla. Nejjednodušší klasifikace se skládá ze dvou odlišných zón: photic a aphotický zóny. Fotická zóna je světelná zóna nebo oblast od hladiny vody do hloubek, ve kterých je intenzita světla pouze kolem 1 procenta intenzity světla na povrchu. V této zóně dochází k fotosyntéze. Převážná většina mořského života existuje ve photické zóně. Aphotická zóna je oblast, která přijímá malé nebo žádné sluneční světlo. Prostředí v této zóně je velmi tmavé a chladné. Organismy žijící v aphotické zóně jsou často bioluminiscenční nebo extrémofilní a zběsile žijící v extrémních prostředích. Stejně jako u ostatních komunit žije v oceánu celá řada organismů. Některé zahrnují houby, houby, mořská hvězdice, mořské sasanky, ryby, krabi, dinoflageláty, zelené řasy, mořští savcia obří řasy.