Když přijde na fosilní záznam, New York nakreslil krátký konec hůlky: Empire State je bohatý na malé, mořské obydlí bezobratlých datující se do počátku Éra paleozoika, před stovkami milionů let, ale pokud jde o, přináší virtuální blank dinosaury a megafauna savci. (Můžete obviňovat newyorský relativní nedostatek sedimentů nashromážděných během EU Mesozoic a Cenozoic Eras.) To však neznamená, že New York byl zcela prostý pravěku, jehož některé pozoruhodné příklady najdete na následujících snímcích. (Vidět seznam dinosaurů a prehistorických zvířat objevených v každém státě USA.)
Před více než 400 miliony let, během Silurian období, hodně ze severní Ameriky, včetně státu New York, byl ponořen pod vodou. Oficiální státní fosilie v New Yorku, Eurypterus, byl druh mořského bezobratlého, známý jako mořský štír, a byl jedním z nejobávanějších podmořských predátorů před vývojem prehistorické žraloky a obří mořští plazi. Některé exempláře Eurypterus dorostly téměř na čtyři stopy, zakrsly primitivní ryby a bezobratlé, které lovily.
Není to známá skutečnost, ale různá stopy dinosaura byly objeveny poblíž města Blauvelt, v newyorské Rockland County (ne příliš daleko od New Yorku). Tyto skladby se datují do konce Triassic období, asi před 200 miliony let, a zahrnují některé provokující důkazy pro rovingové balíčky Coelophysis (dinosaurus nejlépe známý pro jeho prevalenci ve vzdáleném Novém Mexiku). Dokud nejsou přesvědčivé důkazy o tom, že tyto stopy byly skutečně stanoveny Coelophysisem, paleontologové je raději přičítají „ichnogenovi“ zvanému Grallator.
V roce 1866, během výstavby mlýna ve státě New York, pracovníci objevili téměř kompletní zbytky pětitunové Americký mastodon. „Cohoes Mastodon“, jak je známo, svědčí o tom, že tito obři prehistorické slony toulal se po New Yorku v bouřlivých stádech, jak nedávno před 50 000 lety (bezpochyby vedle jejich blízkého současníka Pleistocen epocha Vlněný Mammoth).
Stejně jako mnoho jiných států na východě USA byl i New York relativně vlažný, geologicky vzato, až do pozdní pleistocénové epochy - když ji procházely nejrůznější druhy savci megafauna, od Mammothů a Mastodonů (viz předchozí snímky) až po exotická rody jako Obří krátkosrstý medvěd a Obří Beaver. Bohužel většina z těchto plus-velkých savců zanikla na konci poslední doby ledové, podlehly kombinaci lidské predace a změny klimatu.