Pro hodně z jeho prehistorie, Jižní Karolína byla geologická prázdnota: tento stav byl pokryt mělkými oceány pro většinu z paleozoic a Mesozoic éry, a velké kusy Cenozoic také. Výsledkem je, že zatímco ve státě Palmetto nebyly objeveny žádné neporušené dinosaury, Jižní Karolína má bohaté fosilní záznamy o mořských obratlovců, jako jsou velryby, krokodýli a ryby, jakož i zdravý sortiment savců megafauny, jak se můžete dozvědět tím, že si prohlédnete následující diapozitivy.
Jižní Karolína ležela úplně pod vodou Triassic a jurský období, ale různým regionům se podařilo zůstat na vysokých a suchých místech Křídový, a byli nepochybně osídleni různými druhy dinosaurů. Paleontologové bohužel dokázali odhalit rozptýlené fosílie: několik zubů patřících hadrosaur, špička kosti patřící k a dravec, a další fragmentované zbytky, které byly připisovány neidentifikovanému rodu theropodu (dinosaura jíst maso).
Dnes, aligátoři a krokodýli jižní USA jsou většinou omezeny na Floridu - ale tomu tak nebylo před miliony let, během
Cenozoická éra, když prehistoričtí předci těchto zubatých plazů se pohybovali nahoru a dolů na východním pobřeží. Amatérští fosilní sběratelé objevili rozptýlené kosti četných krokodýlů z Jižní Karolíny; bohužel, většina z těchto nálezů je tak fragmentárních, že je nelze připsat žádnému konkrétnímu rodu.Zkamenělé ryby jsou běžným nálezem v geologických sedimentech Jižní Karolíny; jak je tomu v případě krokodýlů, může však být často obtížné připsat tyto fosílie konkrétnímu rodu. Výjimkou je relativně temný Xiphiorhynchus, prehistorický mečoun z roku Eocene epocha (asi před 50 miliony let). Pokud jde o velryby, mezi relativně nejasné rody, které se před miliony let obklopovaly na pobřeží státu Palmetto, byly Eomysticetus, Micromysticetus a výstižně pojmenovaný Carolinacetus.
Neklidná historie otroctví v Jižní Karolíně zasahuje i do paleontologie tohoto státu. V roce 1725 se majitelé plantáží vysmívali, když jejich otroky interpretovali některé zkamenělé zuby jako nález k prehistorický slon (samozřejmě, tito otroky by znali slony z jejich domovských zemí v Africe). Jak se ukázalo, tyto zuby zůstaly Woolly Mammoths, zatímco údajně vyšší otrokáři předpokládali, že byli zanecháni biblickými „obry“ utopenými ve Velké potopě!
Obrovský cementový lom poblíž Harleyville přinesl fosilní snímek pozemského života v pozdních dobách Pleistocen Jižní Karolína, asi před 400 000 lety. Nejznámějším megafaunským savcem objeveným zde je Smilodon, lépe známý jako Šavlezubý tygr; další rody zahrnují Americký gepard, Obrovská lenochod, různé veverky, králíci a mývalové, a dokonce i lamy a tapíry, které zmizely ze Severní Ameriky na vrcholu moderní doby.