Molekulární sloučeniny obsahují dvě nebo více nonmetals (ne amonný ion). Obvykle můžete molekulární sloučeninu rozeznat, protože první prvek v názvu sloučeniny je nekovový. Některé molekulární sloučeniny obsahují vodík, ale pokud vidíte sloučeninu, která začíná na „H“, můžete předpokládat, že se jedná o kyselinu a ne o molekulární sloučeninu. Sloučeniny sestávající pouze z uhlíku a vodíku se nazývají uhlovodíky. Uhlovodíky mají svou vlastní speciální nomenklaturu, takže se s nimi zachází odlišně od jiných molekulárních sloučenin.
Nonmetals se mohou kombinovat v různých poměrech, takže je důležité, aby název molekulární sloučeniny udával, kolik atomů každého typu prvku je ve sloučenině přítomno. To se provádí pomocí předpon. Pokud existuje pouze jeden atom prvního prvku, nepoužije se žádná předpona. Obvykle je předpona jednoho atomu druhého prvku předpona mono-. Například CO je pojmenován spíše oxid uhelnatý než oxid uhličitý.
Vzorec pro kovalentní sloučeninu můžete napsat ze svého názvu tak, že napíšete symboly pro první a druhý prvek a převedete předpony do předplatného. Například, xenon hexafluoride by byl psán XF
6. Je běžné, že studenti mají potíže s vytvářením vzorců z názvů sloučenin, protože iontové sloučeniny a kovalentní sloučeniny jsou často zaměněny. Vyvažujete náboje kovalentních sloučenin; pokud směs neobsahuje kov, nesnažte se to vyrovnat!