Alchymista je román psaný ve dvou částech a epilog. To se točí kolem andaluského pastýře jménem Santiago a jeho hledání vlastní osobní legendy, která ho vezme z jeho vesnice do pyramid v Egyptě. Na svých cestách potká řadu postav, které mu buď přímo pomohou, nebo ho příkladem naučí hodnotnou lekci.
Melchizedek a alchymista se stávají mentory, zatímco Angličan poskytuje a příklad toho, co se stane, pokud doufáte, že získáte znalosti hlavně z knih a křišťálový obchodník mu ukazuje, jaký druh života člověk vede, pokud člověk nedbá na osobní Legenda. Alchymista je zasazen do vesmíru, kde má každá bytost svou vlastní osobní legendu a kde svět má duši, kterou sdílí vše, od živých bytostí až po hrubou hmotu.
První část
Santiago je mladý pastýř z Andalusie a je šťastný z nadcházející cesty do města, kde byl minulý rok, když potkal dívku, se kterou se pobil. Je dcerou obchodníka, který od něj kupuje vlnu, muže s problémy s důvěrou, který požaduje, aby Santiago střihal ovce před sebou, aby se zabránilo podvodům. Spí v opuštěném kostele, kde má opakující se sen zahrnující pohled na pyramidy. Když to vysvětlí cikánské ženě, interpretuje to docela snadno a řekne, že musí skutečně cestovat do Egypta, aby našel zakopaný poklad. Nejprve váhá, protože si užívá svého života jako pastýř, a musel jít proti vůli svých rodičů, aby ho pronásledoval, protože chtěli, aby se stal knězem.
Poté se setká se starým mužem jménem Melchizedek, který vysvětluje pojem „osobní legenda“, což je osobní naplnění, které je každý povinen sledovat. Je to „to, co jste vždy chtěli dosáhnout. Každý, když jsou mladí, ví, co je jejich osobní legenda. “Říká mu, že musí poslouchat znamení, aby našel jeho poklad, a dá mu dva magické kameny, Urim a Thummim, které odpovídají „ano“ a „ne“ na otázky, na které nemůže najít odpověď sám.
Santiago prodává Tangierovi poté, co prodal své ovce, ale jakmile tam je, je okraden o všechny své peníze mužem, který mu řekl, že ho může vzít do pyramid. To ho příliš neoslňuje, když začíná pracovat pro křišťálového obchodníka, což ve skutečnosti podporuje jeho zaměstnavatele chytrými nápady. Obchodník s křišťály měl sám osobní legendu - pouť do Mekky -, ale vzdal se toho.
Část dvě
Jakmile Santiago vydělá dost peněz, není si jistý, co má dělat. Uplynulo jedenáct měsíců a není si jistý, zda by se měl vrátit do Andalusie, aby si koupil ovce se svými výdělky nebo pokračoval ve své výpravě. Nakonec se připojí k karavanu a cestuje do pyramid. Tam potkává spolucestujícího, známého jako Angličan, který fandí alchymii. Zamíří do oázy Al-Fayoum, aby se seznámil s alchymistou, protože doufá, že se naučí, jak přeměnit jakýkoli kov na zlato. Během cestování v poušti se Santiago učí, jak se dostat do kontaktu s duší světa.
V poušti se válí války, takže karavana zatím zůstává v oáze. Santiago se rozhodne pomoci Angličanovi najít alchymistu. Jejich zdrojem informací je Fatima, dívka, se kterou se setkává, když sbírá vodu ze studny as kterou se okamžitě zamiluje. Navrhuje sňatek s ní a ona souhlasí, pokud dokončí svůj úkol. Je to „pouštní žena“, která umí číst znaménka a ví, že všichni se musí vrátit, než se vrátí.
Poté, co se pustil do pouště, Santiago má vizi, s laskavým svolením dvou jestřábů, kteří útočili jeden na druhého, o napadené oáze. Útočení na oázu je porušením pravidel pouště, a proto ji spojuje s náčelníky, ale tvrdí, že bude muset zaplatit svým životem, pokud oáza nakonec nebude napadena. Brzy po této vizi se setká s cizincem na sobě černé šaty sedící na vrcholu bílého koně, který se ukáže jako alchymista.
Oáza je napadena a díky varování Santiaga jsou obyvatelé schopni lupiče porazit. To nezůstane bez povšimnutí u alchymisty, který se zase rozhodne mentorovat Santiaga a pomoci mu dosáhnout pyramid. Brzy je však zajímá jiná skupina válečníků v poušti. Alchymista říká Santianovi, že, aby mohl pokračovat v cestě, měl by se stát větrem.
Santiago se stále více seznamuje s Duší světa, soustředí se na poušť a nakonec se dokáže stát větrem. To děsí únosce, kteří okamžitě osvobodí jak jeho, tak alchymistu.
Dostanou se do kláštera, kde alchymista přemění nějaké olovo na zlato a rozdělí ho. Jeho cesta se zde zastaví, protože se musí vrátit do oázy, ale Santiago pokračuje a nakonec dosáhne pyramid. Začne kopat na místě, kde snil o nalezení svého pokladu, ale je přepaden lupiči a bije vážně. Jeden z lupičů, když se zeptal na to, co tam Santiago dělal, si ho vysmíval pro svůj sen a zmínil se o tom měl sen o pokladu pohřbeném opuštěným kostelem ve Španělsku a že nebyl tak hloupý, aby ho pronásledoval to.
Epilog
To dává Santiago odpověď, kterou hledal. Jakmile se vrátí do španělské církve, okamžitě vykoření poklad, vzpomene si, že za jeho část dluží cikánské ženě, a rozhodne se znovu sejít s Fatimou.